Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Supt5hO55201 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Supt5hO55201 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Supt5hO55201 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms