Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl35aO55142 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35aO55142 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms