Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrxO55103 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PrxO55103 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrxO55103 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrxO55103 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrxO55103 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrxO55103 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrxO55103 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrxO55103 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrxO55103 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrxO55103 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrxO55103 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrxO55103 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrxO55103 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrxO55103 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrxO55103 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrxO55103 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrxO55103 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PrxO55103 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrxO55103 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrxO55103 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrxO55103 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrxO55103 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrxO55103 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrxO55103 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PrxO55103 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrxO55103 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrxO55103 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrxO55103 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrxO55103 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrxO55103 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrxO55103 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PrxO55103 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PrxO55103 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PrxO55103 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PrxO55103 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PrxO55103 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PrxO55103 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PrxO55103 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PrxO55103 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PrxO55103 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PrxO55103 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PrxO55103 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PrxO55103 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PrxO55103 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PrxO55103 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PrxO55103 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrxO55103 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrxO55103 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrxO55103 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrxO55103 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrxO55103 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrxO55103 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrxO55103 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrxO55103 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrxO55103 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrxO55103 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrxO55103 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrxO55103 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrxO55103 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrxO55103 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrxO55103 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrxO55103 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrxO55103 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrxO55103 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrxO55103 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PrxO55103 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrxO55103 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrxO55103 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrxO55103 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrxO55103 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrxO55103 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PrxO55103 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrxO55103 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrxO55103 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrxO55103 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrxO55103 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrxO55103 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrxO55103 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrxO55103 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrxO55103 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrxO55103 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrxO55103 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrxO55103 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrxO55103 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrxO55103 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrxO55103 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrxO55103 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrxO55103 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrxO55103 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrxO55103 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrxO55103 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrxO55103 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrxO55103 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrxO55103 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrxO55103 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PrxO55103 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PrxO55103 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PrxO55103 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PrxO55103 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms