Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb2O55029 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copb2O55029 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Copb2O55029 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb2O55029 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb2O55029 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb2O55029 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb2O55029 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copb2O55029 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copb2O55029 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb2O55029 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms