Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SlkO54988 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SlkO54988 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SlkO54988 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SlkO54988 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SlkO54988 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SlkO54988 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SlkO54988 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SlkO54988 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SlkO54988 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SlkO54988 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SlkO54988 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SlkO54988 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SlkO54988 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SlkO54988 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SlkO54988 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SlkO54988 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SlkO54988 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SlkO54988 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SlkO54988 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SlkO54988 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SlkO54988 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlkO54988 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlkO54988 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlkO54988 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlkO54988 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlkO54988 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlkO54988 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlkO54988 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlkO54988 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlkO54988 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SlkO54988 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SlkO54988 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SlkO54988 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SlkO54988 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SlkO54988 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SlkO54988 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SlkO54988 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SlkO54988 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SlkO54988 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SlkO54988 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SlkO54988 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SlkO54988 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SlkO54988 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SlkO54988 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SlkO54988 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SlkO54988 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SlkO54988 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SlkO54988 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SlkO54988 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SlkO54988 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SlkO54988 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SlkO54988 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SlkO54988 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SlkO54988 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SlkO54988 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SlkO54988 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SlkO54988 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SlkO54988 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SlkO54988 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SlkO54988 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SlkO54988 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SlkO54988 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SlkO54988 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SlkO54988 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SlkO54988 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SlkO54988 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SlkO54988 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SlkO54988 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SlkO54988 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SlkO54988 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SlkO54988 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlkO54988 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlkO54988 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlkO54988 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlkO54988 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlkO54988 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlkO54988 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlkO54988 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlkO54988 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlkO54988 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SlkO54988 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SlkO54988 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SlkO54988 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SlkO54988 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SlkO54988 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SlkO54988 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SlkO54988 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SlkO54988 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SlkO54988 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SlkO54988 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SlkO54988 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SlkO54988 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SlkO54988 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SlkO54988 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SlkO54988 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SlkO54988 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SlkO54988 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SlkO54988 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SlkO54988 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms