Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sema6bO54951 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sema6bO54951 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema6bO54951 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms