Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Csnk2a2O54833 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms