Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp10aO54827 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp10aO54827 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp10aO54827 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms