Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab33bO35963 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms