Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pik3cdO35904 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms