Protein–RNA interactions for Protein: O35718

Socs3, Suppressor of cytokine signaling 3, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs3O35718 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs3O35718 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs3O35718 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Socs3O35718 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Socs3O35718 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Socs3O35718 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Socs3O35718 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Socs3O35718 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Socs3O35718 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Socs3O35718 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Socs3O35718 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Socs3O35718 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms