Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppfibp2O35711 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfibp2O35711 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms