Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pold2O35654 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pold2O35654 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pold2O35654 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold2O35654 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold2O35654 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold2O35654 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold2O35654 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pold2O35654 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold2O35654 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold2O35654 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold2O35654 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold2O35654 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold2O35654 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms