Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag2O35638 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag2O35638 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag2O35638 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag2O35638 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag2O35638 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag2O35638 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Stag2O35638 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stag2O35638 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms