Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk2O35491 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk2O35491 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk2O35491 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk2O35491 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk2O35491 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk2O35491 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk2O35491 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clk2O35491 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk2O35491 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clk2O35491 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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