Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1dO35473 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1dO35473 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1dO35473 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1dO35473 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1dO35473 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1dO35473 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C1dO35473 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1dO35473 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1dO35473 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1dO35473 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C1dO35473 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1dO35473 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1dO35473 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1dO35473 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1dO35473 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1dO35473 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1dO35473 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1dO35473 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1dO35473 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1dO35473 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
C1dO35473 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1dO35473 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1dO35473 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1dO35473 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1dO35473 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1dO35473 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1dO35473 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C1dO35473 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1dO35473 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1dO35473 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1dO35473 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1dO35473 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1dO35473 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1dO35473 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1dO35473 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1dO35473 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1dO35473 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1dO35473 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1dO35473 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1dO35473 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1dO35473 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1dO35473 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1dO35473 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1dO35473 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1dO35473 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1dO35473 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1dO35473 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1dO35473 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1dO35473 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1dO35473 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1dO35473 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1dO35473 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1dO35473 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1dO35473 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1dO35473 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1dO35473 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1dO35473 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1dO35473 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1dO35473 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1dO35473 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C1dO35473 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms