Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema6aO35464 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6aO35464 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6aO35464 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6aO35464 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6aO35464 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6aO35464 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6aO35464 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sema6aO35464 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms