Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf11O35235 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf11O35235 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms