Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kcns1O35173 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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