Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra3O35118 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra3O35118 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra3O35118 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfra3O35118 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfra3O35118 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfra3O35118 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms