Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Scarb2O35114 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scarb2O35114 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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