Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GclmO09172 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GclmO09172 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GclmO09172 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GclmO09172 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GclmO09172 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GclmO09172 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GclmO09172 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GclmO09172 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GclmO09172 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GclmO09172 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GclmO09172 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GclmO09172 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GclmO09172 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GclmO09172 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GclmO09172 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GclmO09172 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GclmO09172 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GclmO09172 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GclmO09172 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GclmO09172 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GclmO09172 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GclmO09172 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GclmO09172 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GclmO09172 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GclmO09172 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GclmO09172 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GclmO09172 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GclmO09172 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GclmO09172 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GclmO09172 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GclmO09172 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GclmO09172 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GclmO09172 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GclmO09172 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GclmO09172 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GclmO09172 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GclmO09172 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GclmO09172 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GclmO09172 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GclmO09172 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GclmO09172 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GclmO09172 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GclmO09172 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GclmO09172 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GclmO09172 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GclmO09172 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GclmO09172 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GclmO09172 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GclmO09172 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GclmO09172 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GclmO09172 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GclmO09172 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GclmO09172 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GclmO09172 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GclmO09172 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GclmO09172 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GclmO09172 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GclmO09172 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GclmO09172 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GclmO09172 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GclmO09172 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GclmO09172 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GclmO09172 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GclmO09172 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GclmO09172 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GclmO09172 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GclmO09172 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GclmO09172 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GclmO09172 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GclmO09172 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GclmO09172 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GclmO09172 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GclmO09172 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GclmO09172 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GclmO09172 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GclmO09172 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GclmO09172 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GclmO09172 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GclmO09172 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GclmO09172 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GclmO09172 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GclmO09172 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GclmO09172 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GclmO09172 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GclmO09172 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GclmO09172 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GclmO09172 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GclmO09172 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GclmO09172 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GclmO09172 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GclmO09172 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GclmO09172 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GclmO09172 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GclmO09172 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GclmO09172 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GclmO09172 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GclmO09172 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GclmO09172 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GclmO09172 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms