Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Eftud2O08810 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Eftud2O08810 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eftud2O08810 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms