Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp12O08736 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp12O08736 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp12O08736 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp12O08736 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casp12O08736 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp12O08736 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp12O08736 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp12O08736 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casp12O08736 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms