Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm21887J3QQ04 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms