Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ccer2J3QPU5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccer2J3QPU5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccer2J3QPU5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms