Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5849J3QPE5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms