Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Gm19965J3QNY8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Gm19965J3QNY8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gm19965J3QNY8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gm19965J3QNY8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gm19965J3QNY8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gm19965J3QNY8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Gm19965J3QNY8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Gm19965J3QNY8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Gm19965J3QNY8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm19965J3QNY8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Gm19965J3QNY8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Gm19965J3QNY8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm19965J3QNY8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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