Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Zfp616J3QN14 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfp616J3QN14 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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Zfp616J3QN14 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Zfp616J3QN14 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Zfp616J3QN14 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zfp616J3QN14 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 522 ms