Protein–RNA interactions for Protein: J3QN05

Gm21834, Predicted gene, 21834, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21834J3QN05 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21834J3QN05 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm21834J3QN05 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms