Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3336J3QMQ6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3336J3QMQ6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3336J3QMQ6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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