Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28051J3QMA2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28051J3QMA2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms