Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930544D05RikJ3QK56 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930544D05RikJ3QK56 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms