Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21060J3KMU4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm21060J3KMU4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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