Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm20696H3BJN7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm20696H3BJN7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms