Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tubgcp6G5E8P0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tubgcp6G5E8P0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms