Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sclt1G5E861 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms