Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4933406M09RikG3XA12 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933406M09RikG3XA12 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms