Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Obox6G3X9U1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox6G3X9U1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms