Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Chrna9G3X8Z7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chrna9G3X8Z7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms