Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim55G3X8Y1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim55G3X8Y1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms