Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmigd3G3X8R9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmigd3G3X8R9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms