Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r167G3UW71 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms