Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm20604F8WIA3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm20604F8WIA3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms