Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NpcdF8VQB8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NpcdF8VQB8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NpcdF8VQB8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms