Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp9yF8VPU6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp9yF8VPU6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp9yF8VPU6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp9yF8VPU6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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