Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP8

Zc3h7b, Zinc finger CCCH type-containing 7B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h7bF8VPP8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h7bF8VPP8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h7bF8VPP8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zc3h7bF8VPP8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Zc3h7bF8VPP8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h7bF8VPP8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms