Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-M1F7CXU4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-M1F7CXU4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms