Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5798F7BTS7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5798F7BTS7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms