Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm28048F7BCN0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm28048F7BCN0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms